2-1989 - Clermont Leblanc: traspasado del Málaga al Villarreal por 48.000.000 eu
      2-1989 - Borja Valcarcel: traspasado del Villarreal al Mallorca por 50.000.000 eu
      2-1989 - Samuel Valero: traspasado del Villarreal al Bari por 20.000.000 eu
      1-1989 - Víctor Valiente: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Mariano García: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Borja Valcarcel: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Zhelyu Vladigerov: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Sergio Marquez: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Lorenzo Huerta: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Oleh Kravchuk: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Tristán Vaquero: renovado por el Villarreal
      1-1989 - Jerome Bailey: renovado por el Villarreal
      1-1989 - João Assis: traspasado del Braga al Villarreal por 80.000.000 eu
      1-1989 - Oscar Jimenez: despedido por el Villarreal
      1-1989 - Álvaro Casado: despedido por el Villarreal
      1-1989 - Dietmut Baum: traspasado del Hamburger SV al Villarreal por 25.000.000 eu
      12-1988 - Jalal Kalaf: traspasado del Huesca al Villarreal por 10.500.000 eu
      12-1988 - Fred Mooij: traspasado del Villarreal al Ajax por 40.000.000 eu
      11-1988 - Iván Aguinaga: traspasado del Olimpija Ljubljana al Villarreal por 10.000.000 eu
      11-1988 - Antonio Keller: traspasado del Villarreal al Independiente Medellín por 14.000.000 eu
      11-1988 - Francisco Herrera: renovado por el Villarreal
      10-1988 - Armando Muñoz: traspasado del Villarreal al Reading FC por 35.000.000 eu
      9-1988 - Sergej Nekic: traspasado del Tottenham al Villarreal por 4.999.999 eu
      9-1988 - Carlos Saez: traspasado del Villarreal al Sampdoria por 18.000.000 eu
      9-1988 - Tristán Otero: traspasado del Villarreal al Sampdoria por 9.000.000 eu
      9-1988 - Cooper Jones: traspasado del Feyenoord al Villarreal por 38.000.000 eu
      9-1988 - Óscar Assis: traspasado del Braga al Villarreal por 170.000.000 eu
      9-1988 - Rafael Valdes: renovado por el Villarreal
      9-1988 - Otto Petaja: renovado por el Villarreal
      8-1988 - Jovan Stimac: traspasado del Slaven Belupo al Villarreal por 35.000.000 eu